2005年，在党中央和国务院的关怀下，丝绸之路新疆段大遗址保护项目由国家发改委正式批准立项，列入全国重点文物白虎“十一五”发展规划。该项目涉及新疆古代“丝绸之路”主干通道为主线，文物集中的大类型遗址保护区为重点，串联辐射多处全国重点文物保护单位，计划5—8年内完成。
该项目的实施，将为丝绸之路新疆段沿线古代遗址的保存提供良好的环境，在有效保护的前提下，使古代遗址通过合理的开放展示于积极的科学研究，向社会公众展现其所具有的历史文化价值，最终为丝绸之路跨国联合申报世界文化遗产奠定坚实的基础。
为了顺利完成这项重大的文物保护项目，2005年6月7日，我区成立了由自治区副主席担任组长和相关厅局主管领导担任成员的新疆重点文物保护项目领导小组，负责协调各方关系，研究与项目相关的重大事项。领导小组下设执行办公室，由新疆文物局局长盛春寿兼任主任，梁涛担任常务副主任，阿布都艾尼.阿不都拉担任副主任，具体负责项目的执行和管理等工作。
围绕抢救保护项目的实施，执行办公室下设行政部、财务部、工程部、综合部、资料部和科研职能部门。三年来，在上级部门的正确领导下，执行办公室克服了人员少、任务重的困难，任劳任怨，兢兢业业，卓有成效地开展工作。截至2008年8月，已完成交河故城一期抢险加固工程、交河故城安防系统一期工程、高昌故城遗址一、二期保护工程及考古发掘工作、米兰遗址保护设施工程、米兰遗址文物信息采集工程、龟兹佛教文化区文物信息采集与管理系统项目、和田达玛沟佛寺遗址保护及周边考古发掘项目、达玛沟托普鲁克敦佛寺遗址博物馆建设项目、和田地区重点文物保护性设施建设项目、和田佛塔加固项目（尼雅遗址、安迪尔古城遗址、热瓦克佛寺遗址）、和田片区基础文物星系采集项目、七个星佛寺遗址保护规划及测绘、克孜尔尕哈石窟保护规划、克孜尔尕哈烽燧保护规划、民丰县博物馆陈列和布展及屋顶防水处理项目；正在进行的有交河故城安全防范系统二期工程、交河故城防洪工程、阿斯塔那古墓群安全防范系统工程、柏孜克里克石窟防洪工程、克孜尔石窟安防系统工程、克孜尔石窟保护规划、森木塞姆石窟保护规划、苏巴什佛寺遗址保护规划、楼兰故城保护规划、罗布泊南古城保护规划、米兰遗址保护规划、阿巴和加麻扎保护规划、艾提尕尔清真寺保护规划；即将展开的有交河故城二期抢险加固工程、高昌故城三期保护工程、柏孜克里克石窟本体保护和本体防护工程、台藏塔遗址保护工程、克孜尔尕哈石窟抢险加固工程、克孜尔尕哈烽燧抢险加固工程、森木塞姆石窟抢险加固工程、阿巴和加麻扎修缮工程、艾提尕尔清真寺修缮工程等。
大遗址保护在新疆是一项前所未有的文物抢救保护工作，预计的实施时间已过去3年。面对艰巨而复杂的任务，项目执行办的同志们深知自己肩负的重任，决心在余下的时间里，以饱满的工作热情、科学务实的工作态度，保质保量的按时完成所有工程项目。
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